编者按:随着基因组检测技术的发展,采用基因芯片一次检测数十万甚至上百万个单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism, SNP)已成为现实,全基因组关联研究(GWAS)应运而生。GWAS是指在全基因组范围内进行“地毯式”SNP排查,筛选出与疾病或性状关联的基因序列变异。近3年来GWAS成为研究热点,围绕GWAS研究与应用前景的争执也一直不断。在今年5月的美国高血压年会上,专家们展开了激烈争辩。部分专家认为,GWAS的新发现是研究高血压的一大进步,它扩大了人们对高血压发病机理的认知范围,可有助于临床防治高血压;也有专家认为当前的发现对高血压诊治的影响并不大。这项研究耗费巨大,研究结果能否最终使高血压患者受益?这些研究能否真的明确高血压相关的特异性基因?当前GWAS的缺陷在哪里?高血压GWAS将向何处去?
高血压GWAS的困惑与希望
牟建军 刘富强 西安交通大学医学院第一附属医院
GWAS是从人类全基因组范围内的序列变异中筛选出与疾病性状关联的SNP。其优势在于,不再受预先设定的候选基因限制,使得众多功能不明的基因及大量基因间区域的SNP都为疾病的研究提供了线索。然而近年在新英格兰杂志发表了数篇文章辩论GWAS研究的是否有现实意义。因为总结历年的GWAS病理/对照研究数据,发现花费数亿美元的GWAS研究,最后获得的大部分biomarker,对疾病预测的贡献值都非常小,低于7%,而且多数实验结果无法被别人所重复。因此有学者开始对GWAS研究复杂疾病的策略和思路提出了质疑。
高血压是遗传与环境因素相互作用的疾病。原发性高血压研究的一项主要任务是阐明血压升高的遗传学机制,也就是寻找高血压相关基因。虽然多数单基因遗传性高血压疾病的致病基因及其致病突变已被阐明,但发现新病种、新致病基因和新的致病突变还有不少工作可做。目前已列出的高血压侯选基因数目不下200种,它们分别与以下系统或功能有关:肾素-血管紧张素-醛固酮系统、交感神经系统、下丘脑-垂体轴、内皮素、利钠肽、激肽释放酶-激肽系统、类固醇激素、前列腺素、生长因子和激素、骨架蛋白和粘附分子、细胞内信使。脂质代谢、糖代谢、载脂蛋白、离子通道或转运体等,但迄今突破点不多。目前已有应用GWAS技术对其进行大规模的研究,如Framingham Heart Study和Wellcome Trust Case Control Consortium,但他们的结果也不尽相同。这需要我们进一步思考其深层次原因。高血压是多基因网络和多种环境因素相互交织反应